不产甲烷菌为产甲烷菌创造适宜的氧化还原环境
甲烷菌为严格厌氧微生物，只能生活在氧气不能到达的地方。在厌氧生物处理初期，于进料而使空气进入发酵池，原料、水本身也携带有空气，这显然对于产甲烷细菌是有害，它的去除需要依赖不产甲烷菌类群中那些需氧和兼性厌氧微生物的活动。一些厌氧微生并不是被气态的氧所杀死，而是不能解除某些氧代谢产物而死亡。在氧还原成水的过程中，可形成某些有毒的中间产物，例如，过氧化氢(H2O2) 和羟自由基(·OH)等。好氧微生物具有降解这些产物的酶，如过氧化氢酶、超氧化物歧化酶等，而严格厌氧微生物则
缺乏这些酶。
MeCard等在1971测多种微生物的超氧化物歧化酶(SOD)
和过氧化氢酶活性。结果表明 :专性好氧微生物都含有超氧化物歧化酶和过氧化氢酶，过氧化氢酶是一种含铁卟淋蛋白的酶，它可以催化过氧化氢分解成氧和水;某些兼性好氧微生物和耐氧厌氧微生物只有超氧化物歧化酶，但缺乏过氧化氢酶
; 大多数专性厌氧微生物同时缺乏这两种酶，甲烷细菌更是如此。
各种厌氧性微生物适宜生长的氧化还原电位(Eh)不同，通过厌氧微生物有顺序地交替生长和代谢活动，使发酵液氧化还原电位不断下降，逐步为产甲烷菌生长和产甲烷创造适的氧化还原条件。一般只能在100m负值时才能生长。产甲烷菌生长适宜的 Eh在-300mV以下。而一般好氧微生物生长的Eh值为 300~400mV ，Eh值在100mV以上即可生长。厌氧微生物需要如此低的氧化还原电位主要因为它们的细胞中无高电位的细胞色素和细胞色素氧化酶，并且它们生长所必需的一个或多个酶的一 SH，只有在完全还原以后这些酶才能活化或活跃地起酶学功能。例如在淹水土壤，作为电子受体物质的氧、铁、硝酸盐和硫酸盐被有顺序地利用和代谢，使土壤的氧化还原电位降低到-200mV以下，最后才开始有甲烷形成，这时产甲烷细菌才旺盛活动。
在实验室里进行人工培养甲烷菌实验对无氧的要求十分严格。在通气良好的曝气池中或乙酸细 自然界的水域中氧化还原电位也并非均匀。例如细菌聚集成团其内部可产生局部厌氧环境，因而好氧活性污泥也可以测得产甲烷菌活性的存在，并且有人用好氧活性污泥来启动厌氧消化器也得到成功。这些都是由于不产甲烷菌的活动在充满氧气的自然界里为严格厌氧微生物产甲烷菌创造了适宜的厌氧条件。
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